Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms