Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB13Q92826 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB13Q92826 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms