Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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RABGGTAQ92696 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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RABGGTAQ92696 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
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RABGGTAQ92696 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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RABGGTAQ92696 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
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RABGGTAQ92696 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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RABGGTAQ92696 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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RABGGTAQ92696 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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RABGGTAQ92696 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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RABGGTAQ92696 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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RABGGTAQ92696 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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RABGGTAQ92696 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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RABGGTAQ92696 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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RABGGTAQ92696 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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