Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms