Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CTTNBP2Q8WZ74 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTTNBP2Q8WZ74 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms