Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRSK1Q8TDC3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRSK1Q8TDC3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRSK1Q8TDC3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRSK1Q8TDC3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRSK1Q8TDC3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms