Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNIH3Q8TBE1 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH3Q8TBE1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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