Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms