Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTC21AQ8NDW8 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
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