Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTL3Q8N8U3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms