Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2BQ8N4Y2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2BQ8N4Y2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2BQ8N4Y2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2BQ8N4Y2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2BQ8N4Y2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2BQ8N4Y2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2BQ8N4Y2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2BQ8N4Y2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2BQ8N4Y2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2BQ8N4Y2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2BQ8N4Y2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2BQ8N4Y2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2BQ8N4Y2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2BQ8N4Y2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CRACR2BQ8N4Y2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2BQ8N4Y2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms