Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACE1Q8IYU2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACE1Q8IYU2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACE1Q8IYU2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACE1Q8IYU2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACE1Q8IYU2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACE1Q8IYU2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACE1Q8IYU2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACE1Q8IYU2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACE1Q8IYU2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACE1Q8IYU2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACE1Q8IYU2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACE1Q8IYU2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACE1Q8IYU2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms