Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LMNTD2Q8IXW0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms