Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms