Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6L0

PRRT2, Proline-rich transmembrane protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT2Q7Z6L0 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT2Q7Z6L0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms