Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA2D4Q7Z3S7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms