Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF550Q7Z398 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms