Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms