Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL35Q6PF15 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms