Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms