Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIRMAQ69YN4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms