Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms