Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms