Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms