Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC38Q502W7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms