Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms