Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Length 2,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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PCM1Q15154 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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PCM1Q15154 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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PCM1Q15154 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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PCM1Q15154 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
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PCM1Q15154 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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PCM1Q15154 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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PCM1Q15154 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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PCM1Q15154 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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PCM1Q15154 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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PCM1Q15154 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCM1Q15154 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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