Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
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RFTN1Q14699 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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RFTN1Q14699 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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