Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PDE7AQ13946 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PDE7AQ13946 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE7AQ13946 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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