Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOFQ13790 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOFQ13790 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOFQ13790 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOFQ13790 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOFQ13790 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOFQ13790 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOFQ13790 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOFQ13790 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOFQ13790 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOFQ13790 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOFQ13790 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOFQ13790 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOFQ13790 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOFQ13790 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOFQ13790 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOFQ13790 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOFQ13790 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOFQ13790 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOFQ13790 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOFQ13790 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOFQ13790 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOFQ13790 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOFQ13790 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOFQ13790 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOFQ13790 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOFQ13790 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOFQ13790 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOFQ13790 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOFQ13790 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOFQ13790 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOFQ13790 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOFQ13790 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOFQ13790 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOFQ13790 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOFQ13790 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOFQ13790 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOFQ13790 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOFQ13790 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOFQ13790 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOFQ13790 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOFQ13790 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOFQ13790 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOFQ13790 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOFQ13790 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOFQ13790 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOFQ13790 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOFQ13790 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOFQ13790 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOFQ13790 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOFQ13790 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOFQ13790 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOFQ13790 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOFQ13790 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOFQ13790 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOFQ13790 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOFQ13790 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOFQ13790 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOFQ13790 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOFQ13790 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOFQ13790 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOFQ13790 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOFQ13790 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOFQ13790 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOFQ13790 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOFQ13790 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOFQ13790 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOFQ13790 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOFQ13790 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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