Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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DNASE1L3Q13609 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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