Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA5AQ13591 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms