Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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