Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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PTPRSQ13332 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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PTPRSQ13332 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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PTPRSQ13332 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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PTPRSQ13332 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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PTPRSQ13332 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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