Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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