Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME3Q13232 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NME3Q13232 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME3Q13232 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NME3Q13232 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NME3Q13232 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NME3Q13232 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME3Q13232 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME3Q13232 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME3Q13232 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME3Q13232 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME3Q13232 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME3Q13232 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME3Q13232 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME3Q13232 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME3Q13232 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME3Q13232 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME3Q13232 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME3Q13232 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME3Q13232 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME3Q13232 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME3Q13232 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME3Q13232 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME3Q13232 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME3Q13232 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME3Q13232 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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