Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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