Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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