Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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