Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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