Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms