Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms