Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms