Protein–RNA interactions for Protein: Q03052

POU3F1, POU domain, class 3, transcription factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F1Q03052 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F1Q03052 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms