Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms