Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NHLH2Q02577 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms