Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms