Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms