Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms