Protein–RNA interactions for Protein: Q00005

PPP2R2B, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R2BQ00005 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP2R2BQ00005 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms